mw-title">ChIP-seq

染色质免疫共沉淀测序(ChIP-seq)是指通过染色质免疫共沉淀特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段,然后对其进行纯化与文库构建,illumina高通量测序。通过数据与参考基因组比对,peak分析,可在全基因组范围内寻找目标蛋白特异性结合的DNA序列区段,可用于转录因子结合位点或组蛋白特异性修饰位点的研究。

 

实验流程:

 

 

分析内容:

 

人样本的ChIP-seq测序数据进行分析,包括reads预处理、基因组mapping、peaksᅠdetectionᅠ、relationᅠgene、Motif call。

 

技术参数:

 

推荐测序方式: illumina测序平台 PE150,建议至少6G/每个样本。
样本要求: DNA≥30ng ,浓度≥20ng/μl。
建议对有参考基因组的物种进行ChIP-seq。

 

数据结果展示:

 

 

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